锦葵科是植物界重要的一个分支类群，包括许多重要的经济作物，如种子和茎皮纤维来源的棉花和黄麻、制造可可粉和“巧克力糖”原料的可可、热带著名“水果之王”榴莲、观赏花卉植物木槿和优良木材来源的椴树等。随着全球越来越多锦葵科植物基因组的陆续解析，及相关调控等高通量数据的积累，研究者迫切需要一个能够整合基因组、表观修饰组、组和蛋白质组等多层次数据的比较工具，对植物科属的特定生物学过程或基因家族的基因序列、结构、调控等进行比较分析。为此，周宇教授和朱玉贤院士、副研究员合作，共同构建了首个锦葵科植物功能基因组学网站-MaGenDB (。截至目前，MaGenDB共收录了锦葵科9个属共13个的基因组以及相应的全基因组关联分析位点（GWAS）和单核苷酸变异位点（SNP）信息；收录并处理了包括RNA-seq和蛋白质谱等在内的9种共374套组学数据；预测鉴定出2485万个不同类型的功能元件、2897万个基因共线亿个蛋白-蛋白相互作用对。该数据库设计并开发出多种可视化组件与基因组在线比较工具，并通过有效关联将不同类型的数据有机整合到了一起，为用户提供了友好的数据检索、下载和在线分析服务。 该工作也是两个研究团队，继不久前刚刚在《Nature Communications》合作发表有关亚洲棉的精细组图谱工作之后，所取得的又一个重要研究。 生命科学学院博士研究生王得和、樊伟良和郭晓龙为论文共同第一作者，周宇教授、朱玉贤院士和副研究员为论文的共同通讯作者。该工作得到了国家自然科学基金、科技部、武汉大学自主科研交叉学科等项目的资助。返回搜狐，查看更多司马南被抓
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